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Papers & conferences & patents

International Journal


Drug repositioning using drug-disease vectors based on an integrated network
Taekeon Lee and Youngmi Yoon
BMC BIOINFORMATICS, 2018

PISTON: Predicting drug indications and side effects using topic modeling and natural language processing
Giup Jang, Taekeon Lee, Soyoun Hwang, Chihyun Park, Jaegyoon Ahn, Sukyung Seo, Youhyeon Hwang and Youngmi Yoon
JOURNAL OF BIOMEDICAL INFORMATICS, 2018

Identification of drug efficacy change using reconstructed network altered by SNPs on pathway gene
Sukyung Seo, Taekeon Lee, Giup Jang, Soyoun Hwang and Youngmi Yoon
INTERNATIONAL JOURNAL OF DATA MINING AND BIOINFORMATICS, 2018

Identifying the common genetic networks of ADR (adverse drug reaction) clusters and developing an ADR classification model
Youhyeon Hwang, Min Oh, Giup Jang, Taekeon Lee, Chihyun Park, Jaegyoon Ahn and Youngmi Yoon
MOLECULAR BIOSYSTEMS, 2017

Literature-based prediction of novel drug indications considering relationship between entities
Giup Jang, Taekeon Lee, Byung Mun Lee and Youngmi Yoon
MOLECULAR BIOSYSTEMS, 2017

Systematic identification of an integrative network module during senecence from time-series gene expression
Chihyun Park, So Jeong Yun, Sun Jin Ryu, Soyoung Lee, Young-Sam Lee, Youngmi Yoon and Sang Chul Park
BMC SYSTEMS BIOLOGY, 2017

Drug voyager: a computational platform for exploring unintended drug action
Min Oh, Jaegyoon Ahn, Taekeon Lee, Giup Jang, Chihyun Park and Youngmi Yoon
BMC BIOINFORMATICS, 2017

Protein localization vector propagation: a method for improving the accuracy of drug repositioning
Yunku Yeu, Youngmi Yoon and Sanghyun Park
MOLECULAR BIOSYSTEMS, 2015

LGscore: a method to identify disease-related genes using biological literature and Google data
Jeongwoo Kim, Hyunjin Kim, Youngmi Yoon and Sanghyun Park
JOURNAL OF BIOMEDICAL INFORMATICS, 2015

Bulk Aligner: a novel sequence alignment algorithm based on graph theory and Trinity
Junsu Lee, Yunku Yeu, Hongchan Roh, Youngmi Yoon and Sanghyun Park
INFORMATION SCIENCES, 2015

A network-based classification model for deriving novel drug-disease associations and assessing their molecular actions
Min Oh, Jaegyoon Ahn and Youngmi Yoon
PLOS ONE, 2014

Improved method for protein complex detection using bottleneck proteins
Jaegyoon Ahn, Dae Hyun Lee, Youngmi Yoon, Yunku Yeu and Sanghyun Park
BMC MEDICAL INFORMATICS AND DECISION MAKING, 2013

Impact of TGF-b on breast cancer from a quantitative proteomic analysis
Jaegyoon Ahn, Youngmi Yoon, Yunku Yeu Hkkouen Lee and Sanghyun Park
COMPUTERS IN BIOLOGY AND MEDICINE, 2013

ICP: a novel approach to predict prognosis of prostate cancer with inner-class clustering of gene expression data
Hyunjin Kim, Jaegyoon Ahn, Chihyun Park, Youngmi Yoon and Sanghyun Park
COMPUTERS IN BIOLOGY AND MEDICINE, 2013

Identification of functional CNV region networks using a CNV-gene mapping algorithm in a genome-wide scale
Chihyun Park, Jaegyoon Ahn, Youngmi Yoon and Sanghyun Park
BIOINFORMATICS, 2012

CNV detection method optimized for high-resolution arrayCGH by normality test
Jaegyoon Ahn, Youngmi Yoon, Chihyun Park and Sanghyun Park
COMPUTERS IN BIOLOGY AND MEDICINE, 2012

Noise-robust algorithm for identifying functionally associated biclusters from gene expression data
Jaegyoon Ahn, Youngmi Yoon and Sanghyun Park
INFORMATION SCIENCE, 2011

A multi-sample based method for identifying common CNVs in normal human genomic structure using high-resolution aCGH data
Chihyun Park, Jaegyoon Ahn, Youngmi Yoon and Sanghyun Park
PLOS ONE, 2011

Integraive gene network construction for predicting a set of complementary prostate cancer genes
Jaegyoon Ahn, Youngmi Yoon, Chihyun Park, Eunji Shin and Sanghyun Park
BIOINFORMATICS, 2011

Microarray data classifier consisting of k-top-scoring rank-comparison decision rules with a variable number of genes
Youngmi Yoon, Sangjay Bien and Sanghyun Park
IEEE TRANSACTIONS ON SYSTEMS MAN AND CYBERNETICS PART C-APPLICATIONS AND REVIEW, 2010

Direct integration of microarrays for selecting informative genes and phenotype classification
Youngmi Yoon, Jongchan Lee, Sanghyun Park, Sangjay Bien, Hyun Cheol Chung and Sun Young Rha
INFORMATION SCIENCES, 2008

International Conference


Impacts of SNPs in drug efficacy change
Sukyung Seo and Youngmi Yoon
ISMB (Intellegent Systems for Molecular Biology), 2018

Discovering novel drug indications based on NLP and topic modeling
Giup Jang, Taekeon Lee, Soyoun Hwang and Youngmi Yoon
ISMB (Intellegent Systems for Molecular Biology), 2017

Elucidating the mechanism of action of drug based on gene module-module interaction network
Soyoun Hwang, Giup Jang, Taekeon Lee and Youngmi Yoon
ISMB (Intellegent Systems for Molecular Biology), 2017

Finding novel drug indications using drug-disease vectors
Taekeon Lee, Giup Jang, Soyoun Hwang and Youngmi Yoon
ISMB (Intellegent Systems for Molecular Biology), 2017

A novel method for bolstering prediction of therapeutically similar drugs using text mining
Giup Jang, Taekeon Lee, Min Oh, Youhyeon Hwang and Youngmi Yoon
ISMB (Intellegent Systems for Molecular Biology), 2016

Therapeutic target prediction exploiting gene regulatory network
Taekeon Lee, Giup Jang, Min Oh, Youhyeon Hwang and Youngmi Yoon
ISMB (Intellegent Systems for Molecular Biology), 2016

A novel generation of drug pathway elucidates new indication of existing drugs
Min Oh and Youngmi Yoon
ISMB (Intellegent Systems for Molecular Biology), 2015

A method of extracting disease-related microRNAs through the propagation algorithm using the environmental factor based global miRNA network
Youngmi Yoon
THE 4TH INTERNATIONAL CONFERENCE ON BIOMEDICAL ENGINEERING AND BIOTECHNOLOGY, 2015

A novel cancer classifier based on differentially expressed gene network
Youngmi Yoon
THE 2010 ACM INTERNATIONAL CONFERENCE ON BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY

A novel approach to detect copy number variation using segmentation and genetic algorithm
Youngmi Yoon
ACM SYMPOSIUM ON APPLIED COMPUTING 2009

A computational approach to detect CNVs using high-throughput sequencing
Youngmi Yoon
9TH IEEE INTERNATIONAL CONFERENCE ON BIOINFORMATICS AND BIOENFINEERING, 2009

RN-cluster: discovering coherent biclusters which is robust to noise
Youngmi Yoon
BIOTECHNO 2008

k-TSN (k-Top Scoring N): microarray data classification based on rank-comparison decision rules
Youngmi Yoon
FRONTIERS IN THE CONVERGENCE OF BIOSCIENCE AND INFORMATION TECHNOLOGIES 2007

Domestic Journal


유전자를 중간 매개로 고려한 동시발생 기반의 약물-질병 관계 추론
신상원, 신예은, 장기업, 윤영미
한국정보기술학회, 2018

Identifying literature-based significant genes and discoverying novel drug indications on PPI network
박민석, 장기업, 이태건, 윤영미
한국컴퓨터정보학회, 2017

약물-질병 경로 네트워크의 구축과 비교를 통한 신약재창출
황소윤, 황유현, 오민, 윤영미
한국정보기술학회, 2016

유사 약물 예측을 위한 텍스트 마이닝 기반의 새로운 약물 유사도 측정 방법
장기업, 황유현, 오민, 이태건, 윤영미
한국정보기술학회, 2016

Development of query transformation method by cost optimization
Aigerim Bakatkaliyevna Altayeva, 윤영미, 조영임
INTERNATIONAL JOURNAL OF FUZZY LOGIC AND INTELLIGENT SYSTEMS, 2016

Target prediction based on PPI network
이태건, 황유현, 오민, 윤영미
한국컴퓨터정보학회, 2016

Extraction of specific common genetic network of side effect pair, and prediction of side effects for a drug based on PPI network
황유현, 오민, 윤영미
한국컴퓨터정보학회, 2016

판별분석을 이용한 청소년 자살 잠재성 예측 모델
김정태, 윤영미
한국정보기술학회, 2015

통합 마이크로어레이 데이터를 이용한 유방암의 분자적 서브타입의 분류
이지연, 오민, 황유현, 윤영미
한국정보기술학회, 2015

마이크로어레이 데이터와 PPI 데이터를 이용한 에스트로겐 수용체 음성유방암 환자의 예후 특이 네트워크 식별 및 예후 예측
황유현, 오민, 윤영미
한국컴퓨터정보학회, 2015

트위터 사용자정보의 유사성을 기반으로 한 팔로어 분류시스템
계용선, 윤영미
한국컴퓨터정보학회, 2014

음반 순위 추이 예측 시스템
이우구, 한인성, 윤영미
한국정보기술학회, 2014

분산 시스템에서 동작하는 서열 정렬 알고리즘 동향 분석
이준수, 여윤구, 노홍찬, 윤영미, 박상현
한국정보기술학회, 2014

다중 디바이스에서 손 인식을 통한 선택적 제어
장호정, 김태현, 윤영미
멀티미디어학회, 2014

PPI 네트워크상의 거리기반 속성을 이용한 드러그-리포지셔닝
오민, 윤영미
한국정보기술학회, 2013

마이크로어레이 데이터와 임상인자의 통합데이터를 이용한 전립선암의 예후 예측
서보연, 윤영미
한국정보기술학회, 2012

단백질 상호작용 네트워크 및 유전자 발현값을 이용한 중복 허용 단백질 복합체 탐색 방법
안재균, 여윤구, 윤영미, 박상현
정보과학회, 2012

향상된 FFP (Feature Frequency Profile)을 활용한 악성 댓글의 판별시스템
김현정, 윤영미, 이병문
한국정보기술학회, 2011

밈 (Meme) 데이터의 패턴 분석 및 예측 시스템
주지훈, 윤영미
한국정보기술학회, 2011

단백질 상호작용 네트워크를 통한 유전체 단위반복변이와 트랜스유전자 발현과의 연관성 분석
박치현, 안재균, 윤영미, 박상현
정보처리학회, 2011

조건 (암, 정상)에 따라 특이적 관계를 나타내는 유전자 쌍으로 구성된 유전자 모듈을 이용한 독립샘플의 클래스 예측
정현이, 윤영미
한국컴퓨터정보학회, 2010

채팅 데이터의 기분 분류 시스템
윤영미, 이영호
한국컴퓨터정보학회, 2009

유전자 발현 데이터에 적용한 거시적인 바이클러스터링 기법
안재균, 윤영미, 박상현
정보처리학회, 2009

실시간 심음 전송을 위한 원격 의료상담시스템
이병문, 조원희, 윤영미
한국콘텐츠학회, 2009

모바일 상거래 채택시기에 따른 라이프스타일이 모바일 결재시스템에 미치는 영향에 관한 연구
윤영미, 이영호, 민천홍, 윤재희
인터넷전자상거래연구, 2009

Sense and respond 기반의 의료정보 이벤트 모니터링 시스템
강운구, 이영호, 김시라, 윤영미
한국콘텐츠학회, 2009

순위 비교를 기반으로 하는 다양한 유전자 수로 이루어진 암 분류 결정 규칙의 생성
윤영미, 박상현, 변상재
정보처리학회, 2008

2단계 접근법을 통한 통합 마이크로어레이 데이터의 분류기 생성
윤영미, 이종찬, 박상현
정보과학회, 2007

가천길대학의 코압교육시스템에 관한 연구
윤영미, 이병문
한국정보기술학회, 2004

협력적 필터링 기술에서 평균 정보량인 엔트로피를 이용한 효율적인 예측 방법
윤영미, 정경용
한국정보기술학회, 2003

Domestic Conference


자연어 처리 기법과 토픽 모델링을 이용한 신약 재창출의 새로운 방법
장기업, 이병문, 윤영미
2017 한국멀티미디어학회 춘계학술발표대회

유전자 변이에 따른 생물학적 네트워크의 재설계를 통한 약물의 작용 경로 비교
서수경, 이병문, 윤영미
2017 한국멀티미디어학회 춘계학술발표대회

유전자 모튤과 기능을 이용한 약물 작용 메커니즘 분석
황소윤, 이병문, 윤영미
2017 한국멀티미디어학회 춘계학술발표대회

PPI 네트워크 기반의 약물 작용 경로 구축 및 검증
황소윤, 이태건, 윤영미
2016 한국지능시스템학회 춘계학술대회

통합 마이크로어레이 데이터를 이용한 유방암-서브타입의 분류
윤영미
2014 한국정보기술학회 하계학술대회

약물 리포지셔닝 분야에서 단백질 위치 정보의 활용 가능성에 대한 연구
윤영미
2014 한국소프트웨어공학 학술대회

트위터의 노드정보를 활용한 팔로워 추천시스템
윤영미
한국인터넷정보학회 2011년도 제24차 정기총회 및 추계학술발표대회

예후 분석을 위한 속성추출과 분류분석 방법의 최적의 조합 찾기
윤영미
한국인터넷정보학회 2011년도 제24차 정기총회 및 추계학술발표대회

모바일 결제시스템 이용에 영향을 미치는 라이프스타일에 관한 연구
윤영미
한국정보시스템학회 한국인터넷전자상거래학회 2009년 공동춘계학술대회

전체적인 패턴을 고려한 시간 변이 유전자 클러스터의 생성
윤영미
한국정보과학회 데이터베이스연구회 2008

통합 마이크로어레이 데이터에 적용한 선형 비교 기반의 분류자 모델
윤영미
한국정보과학회 데이터베이스연구회 2007

두 단계 접근법을 통한 마이크로어레이 데이터의 분류자 찾기
윤영미
한국정보과학회 데이터베이스연구회 2006

Patent


SNP를 포함하는 약물의 효능변화 예측창치, 방법, 및 컴퓨터-판독가능매체
가천대학교 산학협력단
윤영미, 서수경
국내출원번호: 10-2018-0168914, 2018.12.26

약의 신규 특성을 도출하는 방법, 장치 및 컴퓨터-판독가능 매체
가천대학교 산학협력단
윤영미, 장기업
국내출원번호: 10-2018-0127291, 2018.10.24

의생명 문헌데이터 기반 약효능 도출 방법, 장치 및 컴퓨터-판독가능 매체
가천대학교 산학협력단
윤영미, 장기업, 이태건
국내출원번호: 10-2017-0095278, 2017.07.27

약물의 유사도 판단장치, 방법, 및 컴퓨터-판독가능 매체
가천대학교 산학협력단
윤영미, 오민, 장기업, 이태건
국내출원번호: 10-2017-0039150, 2017.03.28

네트워크 기반의 약체 효능 평가 장치 및 방법
가천대학교 산학협력단
윤영미, 오민, 안재균
국내출원번호: 10-2015-0020364, 2015.02.10
국내등록번호: 10-1776094, 2017.09.01

mRNA 발현 값의 발현 차이를 이용하여 유전자 집합을 검출하기 위한 장치 및 그 방법
연세대학교 산학협력단
박상현, 김정링, 안재균, 여윤구, 윤영미
국내출원번호: 10-2014-0058421, 2014.05.15
국내등록번호: 10-1514762, 2015.04.17

그래프 데이터 기반의 염기 서열 정렬을 위한 장치 및 그 방법
연세대학교 산학협력단
박상현, 이준수, 여윤구, 노홍찬, 윤영미
국내출원번호: 10-2014-0054131, 2014.05.07
국내등록번호: 10-1521212, 2014.05.12

유전자 클래스 결정 방법
연세대학교 산학협력단
박상현, 김현진, 안재균, 박치현, 윤영미
국내출원번호: 10-2014-0018759, 2014.02.18
국내등록번호: 10-1473341, 2014.12.10

Copy Number Variations Detecting Apparatus and Method
연세대학교 산학협력단
윤영미, 박상현, 박치현, 안재균
해외출원번호: US12/712,612, 2010.02.24

Class Label Predicting Apparatus and Method
연세대학교 산학협력단
윤영미, 박상현, 안재균, 신은지
해외출원번호: US12/712,161, 2010.02.24

클래스 레이블 예측 장치 및 방법
연세대학교 산학협력단
박상현, 안재균, 신은지, 윤영미
국내출원번호: 10-2010-0015332, 2010.02.19
국내등록번호: 10-1172490, 2012.08.02

유전체단위반복변이 검출장치 및 방법
연세대학교 산학협력단
박상현, 박치현, 안재균, 윤영미
국내출원번호: 10-2010-0015333, 2010.02.19

매크로 클러스터링 방법과 그 장치, 및 상기 방법을 구현하는 프로그림이 기록된 기록매체
연세대학교 산학협력단
박상현, 안재균, 윤영미
국내출원번호: 10-2008-0127747, 2008.12.16
국내등록번호: 10-0987026, 2010.10.05

바이클러스터링 방법 및 장치
연세대학교 산학협력단
박상현, 안재균, 윤영미
국내출원번호: 10-2008-0017979, 2008.02.27
국내등록번호: 10-0963764, 2010.06.07